ネイティブ UI開発ツールby Vicky-0256

RNAxRay Desktop

キメラリードをマッピングし、RNA–RNA 相互作用を調べ、CPLfold で RNA 構造を予測。

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github.com/Vicky-0256/RNAxRAYRNAxRay Desktop スクリーンショット

概要

RNAxRay の macOS・Windows・Linux 向けデスクトップ版で、MyGo のネイティブ UI で描かれています。RNAxRay Web は別に作られた静的サイトです。CLASH、PARIS、COMRADES などの実験の生リードを Bowtie2 でマッピングしてハイブリッドを検出し、QC、コンタクトマップ、条件間の比較をプロジェクトとしてディスクに保存します。CPLfold はキメラリードを手がかりにオフラインで RNA を折りたたみ、シュードノットも予測します。